Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms