Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NfiaQ02780 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms