Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pax5Q02650 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms