Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms