Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms