Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mc1rQ01727 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms