Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.1 ms