Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax8Q00288 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms