Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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