Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arf1P84078 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Arf1P84078 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Arf1P84078 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Arf1P84078 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms