Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx3P81067 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms