Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx2P80206 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx2P80206 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms