Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms