Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Acta1P68134 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms