Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P58686 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P58686 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms