Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp25P57080 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms