Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PctpP53808 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PctpP53808 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PctpP53808 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PctpP53808 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PctpP53808 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PctpP53808 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
PctpP53808 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PctpP53808 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms