Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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