Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf9P41274 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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