Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TtlP38585 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TtlP38585 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TtlP38585 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TtlP38585 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TtlP38585 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TtlP38585 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TtlP38585 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms