Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprkP35822 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprkP35822 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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