Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp4P35123 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp4P35123 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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