Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RxraP28700 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RxraP28700 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RxraP28700 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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