Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PdgfraP26618 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
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PdgfraP26618 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PdgfraP26618 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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