Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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SftpcP21841 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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SftpcP21841 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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SftpcP21841 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpcP21841 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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SftpcP21841 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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SftpcP21841 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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SftpcP21841 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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SftpcP21841 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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SftpcP21841 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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SftpcP21841 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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SftpcP21841 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms