Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou5f1P20263 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms