Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18532 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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P18532 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18532 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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P18532 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18532 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms