Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms