Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms