Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06323 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06323 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06323 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06323 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06323 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06323 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06323 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06323 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06323 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06323 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06323 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P06323 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06323 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06323 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06323 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06323 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06323 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06323 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P06323 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06323 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms