Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P04212 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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