Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P01649 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P01649 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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P01649 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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P01649 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P01649 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P01649 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
P01649 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms