Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
E2f6O54917 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E2f6O54917 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms