Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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