Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Clk2O35491 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Clk2O35491 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Clk2O35491 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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