Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Vmn1r223-201ENSMUST00000091719 1086 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 4930408K08Rik-201ENSMUST00000195936 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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ColqO35348 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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ColqO35348 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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ColqO35348 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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ColqO35348 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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ColqO35348 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ColqO35348 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ColqO35348 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ColqO35348 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ColqO35348 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ColqO35348 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
ColqO35348 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ColqO35348 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ColqO35348 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
ColqO35348 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ColqO35348 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms