Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms