Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MttpO08601 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MttpO08601 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MttpO08601 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MttpO08601 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MttpO08601 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MttpO08601 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MttpO08601 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
MttpO08601 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MttpO08601 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
MttpO08601 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MttpO08601 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms