Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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