Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp35M0QWN7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms