Protein–RNA interactions for Protein: J3QPN2

Gm21870, Predicted gene, 21870, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21870J3QPN2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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