Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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