Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms