Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc180J3QNE4 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms