Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top6blJ3QMY9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Top6blJ3QMY9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Top6blJ3QMY9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Top6blJ3QMY9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Top6blJ3QMY9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms