Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Cldn34c3J3QJW5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Cldn34c3J3QJW5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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