Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms