Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm17535J3KMR8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm17535J3KMR8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm17535J3KMR8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm17535J3KMR8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17535J3KMR8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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