Protein–RNA interactions for Protein: F8VQG7

N4bp2, NEDD4-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp2F8VQG7 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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N4bp2F8VQG7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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N4bp2F8VQG7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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N4bp2F8VQG7 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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N4bp2F8VQG7 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
N4bp2F8VQG7 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms