Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms